N-钙蛋白（N-Cadherin）主要表达于正常组织的神经细胞、内皮细胞、肌细胞及早期造血干细胞。此外在多种肿瘤如间皮瘤、脊索瘤、滑膜肉瘤、恶黑、上皮样肉瘤、上皮样血管肉瘤及卵巢的子宫内膜样肿瘤和浆液性肿瘤等表达。可作为鉴别间皮瘤和腺癌的指标之一。
神经丝蛋白（NF）是神经元特异性中间丝蛋白，由三个不同分子量的亚单位构成的多聚体，以不同的比例分布于中枢、外周神经元以及肿瘤中，它被广泛用于识别神经元及其过程。。它不与GFAP、角蛋白、波形蛋白、结丝蛋白等中间体发生交叉反应，也不与小细胞肺癌发生反应。神经丝已被证明与神经母细胞瘤、神经节瘤、嗜铬细胞瘤、Merkel细胞癌和类癌肿瘤发生反应，有助于神经母细胞瘤和嗜铬细胞瘤的诊断与鉴别诊断。
p57是细胞周期抑制剂和肿瘤抑制基因，主要位于11号染色体上。在成人组织中，p57在骨骼肌、心脏、肺、肾、脑、胰腺和睾丸中表达，而肝脏和脾脏则为阴性，在正常胎盘组织中，细胞滋养层、中间滋养层、绒毛间质细胞和母体蜕膜中可见p57的核染色，而合体滋养层细胞为阴性。完全性葡萄胎完全由父系DNA形成，p57表达阴性，而部分性葡萄胎是三倍体（双精受精），p57呈阳性表达。所以p57可作为早期葡萄胎妊娠诊断及鉴别诊断的标记物。
胎盘碱性磷酸酶（PLAP）见于正常胎盘，从妊娠第 8 周开始在胎盘中表达，并且在整个妊娠期间浓度不断增加。 在某些生殖系统肿瘤、胃肠道肿瘤及肺癌中可作为一种癌胚抗原而表达，可标记生殖细胞肿瘤及肺、胃、胰腺、乳腺和卵巢癌。
S-100是一种可溶性酸性蛋白，通常存在于源自神经嵴（雪旺细胞和黑素细胞）、软骨细胞、脂肪细胞、肌上皮细胞、巨噬细胞、朗格汉斯细胞、树突细胞和角质形成细胞的细胞中。S-100 蛋白在星形细胞瘤、少突胶质瘤、室管膜瘤、神经母细胞瘤、神经鞘瘤、恶性黑色素瘤、脂肪肉瘤中表达。S-100的诊断价值因其广泛表达而受到限制。在诊断黑色素瘤中比较有价值，在转移性黑色素瘤中比HMB-45表达较多。
